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克雷格·文特 发表评论(0) 编辑词条

克雷格·文特(J. Craig Venter)。John Craig Venter (born October 14, 1946) is an American biologist and entrepreneur, most famous for his role in being one of the first to sequence the human genome and for his role in creating the first cell with a synthetic genome in 2010. Venter founded Celera Genomics, The Institute for Genomic Research and the J. Craig Venter Institute, now working at the latter to create synthetic biological organisms and to document genetic diversity in the world's oceans. He was listed on Time magazine's 2007 and 2008 Time 100 list of the most influential people in the world.
 美国洛克菲勒J. Craig Venter研究所的Craig Venter等人在今年的《科学》杂志上宣布,将人工合成的染色体植入了细菌细胞,得到表达人工染色体的新支原体,他们将其命名为实验室支原体(Mycoplasma laboratorium)。负责该项研究的Venter在美国学界素以“科学怪人(Bad boy of Science)”闻名。  

生物通综合:美国洛克菲勒J. Craig Venter研究所的Craig Venter等人在今年的《科学》杂志上宣布,将人工合成的染色体植入了细菌细胞,得到表达人工染色体的新支原体,他们将其命名为实验室支原体(Mycoplasma laboratorium)。负责该项研究的Venter在美国学界素以“科学怪人(Bad boy of Science)”闻名。

在过去的几年里,Venter和同事确定出,一种最小的基因组至少需要含有400个基因来维持一个自由生活的细胞。他们通过系统地敲除简单细菌Mycoplasma genitalium(一种通过性传播、感染人类的寄生虫)的基因达到了。 

Venter希望能够利用构成DNA的核苷化学合成这个基因组(生命必须基因组),然后将它放入一个细菌细胞中。达到这个目标需要一种替换能用合成的基因组替换掉Mycoplasma基因组的技术。这项新的研究证实这种基因组的移植是有可能的。

Venter的研究组尝试将Mycoplasma mycoides的基因组转移到一个同类病菌M. capricolum中。这两种细菌都能感染山羊、绵羊和牛。依据它们合成的蛋白质,最终得到的这些细胞似乎已经完全变成了M. mycoides种。由于Mycoplasma细胞太小,很难利用机械方法来操作,因此研究人员不得不设计很费事的化学和物理方法来从一种细菌中提取基因组并将其引入到另外一种细菌中。这个过程说起来很容易,但实际操作起来则非常复杂。
Venter之前因希望能够为他的最小基因组申请专利而引发争议,他表示一旦完成了基因组的准备工作,则这项移植技术将会使他们能在很短的时间里合成第一个细菌。他表示,这个过程大概需要数周或数月。

事实上,Venter曾对人类基因组计划的完成作出过重大贡献。1990年,来自法国、德国、日本、中国等六国的科学家组成了一个多国合作小组开展人类DNA测序工作以揭开人类基因组之谜。最初他们希望2005年前能够获得人类DNA序列的图谱, 但是到1997年, 在耗费了巨额资金和一半预定时间之后,多国合作小组仅完成了3%的测序工作。 

与此同时, 遗传生物学家Craig Venter博士, 创立了一个名为“Celera Genomics”的风险投资公司并宣称他将在无政府投资条件下早于多国合作小组完成人类基因组计划。就在1991年,Craig Venter开发出新的测序技术。Celera采用了如“散弹枪”等一系列新的方法并很快真的追上了多国合作小组。看到自己即将失利, 多国合作小组在美国总统克林顿的撮合下开始与Celera合作, 在2000年6月完成了90%, 2001年初完成了99%的人类基因组草图. 有意思的是多国合作小组在英国的自然(Nature)上而Celera在美国的科学(Science)上各自独立的在同一周发表论文, 在2001年2月12日的记者招待会上联合宣布人类基因组测序工作的完成.。 

也许是出于政治原因,两大权威科学杂志均在没有100%检验并证实结论的情况下刊登了他们的论文, 而且两个小组由于竞争关于统一课题的成果都没有做足够的方差检验. 事实上他们的成果中大概有0.14%(大约400万碱基对)序列差异, 还需更完整的检验。

多国合作小组将30亿碱基对切成几个细菌人工染色体(BAC)片断, 然后切成更短的片断以便使用碱基序列分析仪. 普通BAC含有约150,000碱基对, 这就是说200,000个BAC就可以足够包含全人类基因组。理论上说200,000个BAC足够了, 但事实上他们使用了300,000个BAC. 因为DNA自动测序仪可一次读取约500碱基. 他们随机截取BAC克隆体并读取首端和末端各500个碱基, 然后组合得到大于1000碱基的全序列. 通过比较重叠的片断, 连接然后重建序列. 多国合作小组通过分析5800万碱基的重叠读取了230亿碱基对序列, 这是人类基因组的八倍. 99%草图有400,000个片断. 其余的1%是将这些片断连接以及24条染色体(22对和X,Y), 尚待后续工作。 

而Craig Venter带领的Celera研究组的进展略有不同。他没有使用BAC克隆体而是将全基因组随机切成几千万片断, 读取每一片段的序列然后拼接它们。尽管看上去更直接,由于要比较几千万个序列信息并找到重叠部分,这项工作需要大量的计算机工作。为解决这个问题Celera的合作者们发明了高效的生物信息学(Bioinformatics)运算法则, 从而得以短期内赶上多国合作小组的工作。(生物通编者 雪花) 
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科学怪人编辑本段回目录

生物学界,有一个人无论做什么你都不要觉得惊奇,这个人就是John Craig Venter。
早年的时候当过兵,打过越战。打仗打得很郁闷,因为不知道杀人或者被杀有什么意义,所以决定自杀。Ventor自杀的方法非常有创意:从海岸拼命的往深处游,游到没劲掉下去淹死。我靠,太有才了。这哥们于是自杀,游到没劲的时候突然想明白自己应该做什么,又不想死了,所以就游回来了。
打越战不是闹着玩的。美国大兵回国,以后工作真的是个问题,要不然也不会有兰博这样的。Ventor有抱负,估计那时候想法也简单,就是农妇山泉有点田。当然那时候没有。Ventor属于大器晚成型的人物。所谓大器晚成,就是年轻的时候穷困潦倒,潦倒到没法活的时候,绝大多数人也就认命了,继续活下去。极少数的人,会奋力一搏。中国有没有?至少有两个。一个大概是45岁还在做博士后,遇上小自己10来岁的某公还得恭恭敬敬喊声:教授号。当然后来不一样了:7年做院士,9年做校长。另一个开拖拉机出身,到研究所刷瓶子打杂,后来老板觉得小伙有前途,去听研究生课吧。很认真,很欣赏,送出国去了。回来之后做个教授也就拉倒了。Over了?当然没有。说是2000年的第一场雪之后,突然拍脑袋想出个好的idea,一个月摆平实验,nature genetics。05年的院士。机会,给有准备的人。如果真的没有机会,那就自己创造吧。

总之,Ventor早年的时候一贯的潦倒。大约90年前后,那时候Ventor也即将步入45了。取得什么成就了呢?nothing, 或者说,zero。但是机会终于来了。话说某年某月某日,Ventor宣称自己发明了个技术EST,据说很好用。当时一帮大牛都在忽悠人类基因组,对这个东西不感冒。比如沃森就讲:这东西猴子都能做。另一个是吉尔伯特或者博格,形容:茶杯里的风暴。总之就是很鄙视。

话说有两个顶尖学者,一个是美国癌症研究院的佛格斯坦,另一个是科罗。两个人做的东西一样,都是找老年痴呆症里面的关键基因。都找了10几年,互相批评,但是谁都找不到。老佛不知道哪跟筋搭错了,心血来潮试了把EST。这思想其实也挺前卫的:大家都批评,你还敢用,牛逼。结果真的搞出来了。哗,轰动啊。这样Ventor就牛逼了一把。这是第一次,不是最后一次。

50知天命,Ventor不一定知天命,但起码知道自己的命。刚过50,其就放卫星,宣布2000年摆平人类基因组,并且把所有基因申请专利。那时候沃森已经不在位了,主要是collins管人类基因组,上千人的的大工程,效率可想而知的低啊。当时big names语言,2015年可以搞定人类基因组,现在Ventor号称提前15年,大家都不信。但是申请专利这个事情,的的确确把大家都吓住了。有压力才有动力,于是这帮big names们想了两个招,一个就是跟国会反映,基因不能申请专利,另一个招就是忽悠国际同行。前者很有效,因为Ventor不得不整天去跟国会议员这帮鸟人吵架。美国的国会议员,那不是一般人。那么高的工资,还什么都不会,不容易啊!不整点儿事情怎么糊弄老百姓?所以要整天开会,装作很认真地为国为民,其实就是混饭的。另一个招也很有效,比如中国就被忽悠参加,做1%。最后,其实还是打不赢。因为Ventor太快了。全世界最顶尖的科学家打不过一个神经病,这要传出去以后怎么混?所以说,能拿诺奖,真不是盖的。学术拼不过,有办法。这帮big names就去忽悠克林顿,无非是什么和谐社会之类的。克林顿真的被忽悠住了。所以说,美国有史以来最能赚钱的总统的智商,其实就那么回事。兔那义务,兔森泼。总统出面,Ventor实在没辙。OK,这几年你们这帮鸟人跟我玩阴的,我也就当个屁。玩的这么绝,怎么搞?后来的结局自然是所谓的皆大欢喜,大家一起发文章,克林顿牛逼哄哄宣布人类疾病从此结束,等等。其实啥都没解决。反正忽悠呗。
这就苦了Ventor,没有专利,没钱了。虽然补了10个亿,可是股票跌的太厉害。正好Ventor自己也不知死活,又放卫星宣称10年之内让人类基因组测序降到1000美元/个。震撼啊。股东们琢磨了一下,总统整天被这帮big names忽悠,要是做成了再被搞,又是什么钱赚不到。本着心不狠,站不稳的原则,开会一致通过:开除。事实证明,Ventor这个idea是可行的。因为测序的价格现在是越来越便宜。如果真的是Ventor在做,那么大家现在人人都拿个光盘存基因组了。可如果真的是Ventor做,一定赚不到钱:你觉得奥巴马的智商能比克林顿高?

后来就是Ventor自己开公司。当时康奈尔大学有个Collins提Synthetic biology的概念,与哈佛系统生物学系主任Marc的概念相对。Collins到处忽悠人做,没多少人理会。但是Ventor理了。然后就是测微生物,正儿八经搞生命制造。

这就是最近这篇文章的由来。不稀奇。有争议,不稀奇。总之都很正常。当然,假如过两年Ventor又是亏得连裤头都没有,也不稀奇。大不了裸奔。

评:有史以来最最疯狂的科学家,拥有无与伦比的意志和决心,拥有单挑整个世界不落下风的勇气和能力,毁誉参半。你可以喜欢或者反感,但你不可能不被震撼。

科学狂人克雷格·文特:人造生命起步编辑本段回目录

科技时代_科学狂人克雷格·文特:人造生命起步

生物学家克雷格·文特

  特立独行的科学“狂人”克雷格·文特,首次创造出人工生命,其影响将不亚于当年克隆羊多利问世

  《新世纪》周刊 记者 于达维

  一位半路出家的越战老兵,竟然依靠计算机创造出新的生命。

  他就是克雷格·文特(J. Craig Venter)。5月21日的美国《科学》杂志网络版发表了文特及其同事的惊人成果:在一个被掏空内核的细菌中,植入由人工合成的基因组,不久后,新的基因组取得了这个单细胞生物的控制权,从而形成了新的生命。

  “当发现带有人工特征的细胞开始繁殖,我们欣喜若狂。”文特说,“它是一个活生生的物种,是这个星球上生命的一部分。”

  中国科学院院士、深圳华大基因研究院理事长杨焕明用“借鸡生蛋”来形容这种创造新生命的方式。他对本刊记者表示,科学界此前有过类似尝试,而这个细菌完全可以独立生存,并且生长速度很快。“尽管是‘借鸡生蛋’,但所有蛋白质都变过来了,只是借用原来细胞中的细胞质。”

  毫无疑问,从创造一个细胞,到创造一种我们熟知的动植物生命,依然非常遥远。这种以人工方式创造的新生命,在伦理和生物安全等方面也有很大争议和不确定性。

  文特已经获得石油公司和制药公司几亿美元的支持。在不少人士看来,其研究成果完全可能引发一场新的工业革命。

  5月27日,在美国国会举行的听证会上,民主党议员亨利·韦克斯曼(Henry Waxman)称,这意味着一个科学新时代的开端,同时也要避免研究成果被不负责任地使用。

  “向一潭死水投巨石”

  此前,文特曾经以一己之力,单挑由各国政府联合资助的庞大科学家团队,看谁首先破解人类基因组这部天书。如今,他又将计算机设计的生命蓝图变成现实,震撼了科学界的神经。

  文特1946年生于摩门教总部所在地—美国犹他州盐湖城,但他的家庭被逐出教门。在这个美国最为循规蹈矩的城市中,文特从小就表现出特立独行的性格。

  高中毕业后,文特加入美国海军陆战队,成为越南战场上美国海军医院的看护兵。他目睹美军在越南北部发起血腥攻势,而医院中伤兵的痛苦呻吟深深刺痛了曾经玩世不恭的他。

  “越战彻底改变了他,”文特的前妻、分子生物学家克莱尔·弗雷泽(Claire Fraser)曾经说,“他从此明白,每一天每一分钟都必须过得有意义。”

  回到美国后,文特先是在加州一所社区大学就读。六年后,他在加州大学圣迭戈分校取得生理学、药学的博士学位,到美国东部的纽约州立大学布法罗分校任教。

  在布法罗期间,文特与第一任妻子、同门师姐芭芭拉(Barbara Joan Rea)离婚,迎娶了自己的学生克莱尔。这段婚姻一直维持到2005年。

  1984年,他加入美国国家健康研究院(NIH)下属的神经病学研究所,负责寻找并破译人类脑细胞中某种接收肾上腺素的蛋白所包含的基因密码。

  当时,还是分子生物学高速发展的早期,解码速度非常缓慢。1987年,文特读到一篇关于自动解码仪器的文章,很快成为这种仪器的最早拥有者之一,令自己的研究大大加快。

  到1991年6月,文特已经识别出347个基因,而此前整个科学界的记录不过是2000个基因。但他的速度并未引来同行的赞许,因为其张扬的做派惹恼了很多人。

  在一些科学家看来,文特的工作都是机器完成的,科学含量不高。诺贝尔奖获得者、号称“DNA之父”的詹姆斯·沃森(James Watson)曾经嘲讽说,文特的工作猴子都能做。

  由于难以从政府申请到更多经费,文特与妻子一起离开政府研究机构,成立了自己的基因组研究所。在诺贝尔奖得主汉密尔顿·史密斯(Hamilton Smith)的帮助下,文特发明了一种读取基因序列更便捷的“散弹枪”技术。就连向来对文特不屑一顾的美国能源部和NIH最后也不得不承认,这项技术确实更胜一筹。

  1998年,文特参与创办“赛莱拉”(Cerela)公司。文特宣称,将在2001年完成全部人类基因组密码的排序和组合工作,并且要为研究成果申请专利。

  杨焕明对本刊记者表示,这是文特惹恼科学界的几件不那么漂亮的事情之一。因为如果申请了专利,就相当于对后来者关上大门。“他是主流中的另类,得罪人的事情做得比较多。”

  文特此举实际上也是对所有使用政府经费的官方科学家的挑战,并促使欧美等国政府增加对人类基因组计划的投入,以避免赛莱拉公司可能造成的垄断。人类基因组计划负责人弗兰西斯·柯林斯(Francis Collins)后来承认,“文特向一潭死水里投了块巨石。”

  2000年6月26日,时任美国总统克林顿宣布,由各国政府出资执行的“人类基因组计划”和文特完成了人类基因组排序草图。但业内人士心知肚明,官方科学家团队可以说是被文特一个人击败了。

  2007年和2008年,文特两次被美国《时代》周刊选为全球最有影响力的100人之一。

  “辛西娅”诞生

  由于未能为人类基因组的解码成果申请专利,文特无法为塞莱拉创造价值,公司在股票市场上逐渐失宠,文特只好离开。

  但从那以后,文特得到了金融界和产业界的青睐。在源源不断的资金支持下,他的胃口越来越大。

  文特的一个计划是:利用人造微生物来生产氢燃料;或者让这些人造微生物从大气中吸收二氧化碳,以帮助应对气候变化。

  这一计划听上去有些天方夜谭,但诺贝尔奖获得者史密斯是文特的坚定支持者。2005年6月,他们共同成立合成基因组(Synthetic)公司,致力于用人造微生物系统来生产清洁燃料和生化药物。

  2009年7月,埃克森美孚石油公司也宣布一项高达6亿美元的合作计划,与文特的公司共同研发下一代生物燃料—制造一种可以吸收二氧化碳并将其转化为燃料的水藻。

  而为了人工创造出细菌这种微生物,文特及其领导的克雷格·文特研究所的20来位科学家前后花费15年时间和4000万美元,才得以成功。

  他们选取一种山羊蕈状支原体细菌,将它的染色体解码后,根据计算机程序,利用化学方法对其进行人工复制,而后将这条人造DNA放入另外一个被掏空内核的山羊支原体细菌内。几个小时之内,受体细菌内原有DNA的所有痕迹全部消失,人造细胞不断繁殖。新的生命诞生。

  这次试验的成功之处,就在于让人工DNA占领一个没有遗传物质的细胞,然后利用细胞中的原料将这一细胞据为己有,成为一个新的生命。

  文特给这个新生命起名为“辛西娅”(Synthia)。他说:“‘辛西娅’其实是一个人工合成的基因组,是第一个人工合成的细胞,也是第一种以计算机为父母的可以自我复制的生物。这基本上是一种信息处理过程的结果,我们的基因代码就是我们的软件。”

  牛津大学的应用伦理学教授朱利安·萨乌雷斯古(Julian Savulescu)说:“文特正在朝着扮演上帝的方向前进—用人工的方法创造自然界从未存在过的生命。”

  这一成果的推出,也说明人类已经具备根据自身意志设计生命的能力。美国哈佛大学医学院的诺贝尔奖获得者杰克·绍斯塔克(Jack Szostak)是人工生命领域的先驱之一。其研究小组的张胜龙博士对本刊记者表示,他们正研究如何在实验室再现地球上生命的起源,而生命的两个重要特征分别是,拥有可以与外界隔离又能够交换物质的细胞膜,以及可以储存和传递遗传特征的大分子。目前,科学家已经具备实现这两个条件的能力。

  “人造生命”价值几何?

  2007年,接受英国《新科学家》采访时,文特被问到一旦真的合成出细菌这类微生物,将会用来干什么。他回答说,今后20年,整个化学工业和大部分石油公司都要依靠合成基因组学,人类需要找到另一种方式把地球中的碳提取出来,将其燃烧,再把它释放回大气。

  如今,人造细菌已经成为现实。文特说:“从理论上讲,我们可以改变生物的整个基因,去除不想要的功能,加入希望的功能,创造出新的适合工业化的有机体。在这项实验完成之前,以上设想都只是理论。”他预计,这项成果的价值超过万亿美元。

  文特还与一家制药公司开始讨论,如何利用这一突破性的技术,帮助他们加快疫苗和药物的制造速度。

  在5月27日的国会听证会上,这一突破引起了议员们的浓厚兴趣。共和党议员乔·巴顿(Joe Barton)开玩笑说,他乐于支持“可以使选民投票时偏向共和党”的合成基因组技术。此外,这位议员担心,新技术被用来制造人,而他喜欢的是造人的原始方式,“那样很好玩”。

  文特的回答是,其研究团队目前只拿微生物做文章,根本没有能力、也不应该用这种技术去制造人。

  他同时在听证会上透露,已经就此项研究申请了13项专利。

  当然,文特也承认,这种技术有可能被滥用。他举例说,计算机和网络开始普及之后,计算机病毒就开始泛滥,黑客可以通过编制恶意程序来制造计算机病毒。而这种技术的成熟,完全可能导致生物黑客的兴起,一些人会利用这种技术来设计制造真正的病毒。

  萨乌雷斯古说,虽然这种技术的前景还非常遥远,但却是真实和显而易见的,其危险性也同样真实和显而易见,因此需要制定新的安全标准,并防止这类技术被用于军事和恐怖主义。“它可以被用来制造最为恐怖的生物武器,对人类的挑战是,吃到苹果的时候别咬到虫子。”

  目前,美国总统奥巴马已经敦促生物伦理委员会,“评估此项研究将给医学、环境、安全等领域带来的任何潜在影响、利益和风险”。

  杨焕明则表示,“人造生命”的成功,将人们对生命的理解推进了一大步。人类已经从分子、细胞、组织、器官乃至生命水平的多个层次上,全面进入生物学的世纪,但中国在许多方面至今没有涉猎,应该赶上去。

  他还表示,文特研究成果的重要性不亚于克隆羊多利,人类已经学会阅读基因组这本“天书”,现在已经到学会写作的时候——根据基因组序列测定的结果,重新设计基因组、细胞和生命。文特的成功等于是迈出第一步,“让我们听到了脚步声”。

美国克莱格 凡特研究所编辑本段回目录

克莱格•凡特研究所(J. Craig Venter Institute)   www.jcvi.org

美国克莱格•凡特研究所(J. Craig Venter Institute)   J. Craig Venter

克莱格·凡特(又译奎格·文特或克雷格·文特尔,全名John Craig Venter,常写成J. Craig Venter,1946年10月14日-)出生于美国盐湖城,是一位生物学家及企业家。时代杂志在2000年7月将凡特与人类基因组计划代表佛兰西斯·柯林斯同时选为封面人物[1],又在2007年将他选进世界上最有影响力的人之一[2]。

目录
1 生平
1.1 人类基因组计划
1.2 目前工作 

 美国Celera Genomics Group   美国Synthetic Genomics

  生平
克莱格·凡特在越战爆发之后,曾受征召加入美国海军服役。他的学术生涯是从进入加州一所称为圣马帝奥学院(College of San Mateo)的社区大学(community college)开始。之后凡特在加州大学圣地牙哥分校得到了三个学位,分别是1972年的生物化学学士,与1975年的生理学及药理学哲学博士。接着他又进入纽约州立大学水牛城分校担任教授。1984年,凡特进入了美国国家卫生研究院(National Institutes of Health,缩写NIH)。

于NIH期间,凡特学到了快速辨识细胞中mRNA的技术,并将其应用在人类大脑基因的辨认。以这种方式发现的互补DNA(cDNA)序列片段称为表现序列标签(Expressed sequence tags,缩写ESTs),此名称是由基因组研究院(The Institute for Genomic Research,缩写TIGR,由凡特建立于1992年)的Anthony Kerlavage所创。在一场具争议性的官司中,凡特试图将这些辨识出来的基因申请成为专利,但最后败诉。

 人类基因组计划
更多资料:人类基因组计划
克莱格·凡特是塞雷拉基因组公司(Celera Genomics)的创办人与前任总裁,此公司在他的带领下展开与人类基因组计划互相竞争、且具有商业目的之研究计划,此后他逐渐成名。这场计划开始于1999年,特色之一是使用了“霰弹定序法”(shotgun sequencing)。塞雷拉研究计划的目的是要建立一个需付费才能使用的基因组数据库。此目的在遗传学界并不受欢迎,并激起许多团队加速将成果公开。

塞雷拉公司用来研究基因组的DNA来自五个人,其中一位便是凡特本人。最后私有化的意图并未达成,而凡特与人类基因组计划的代表佛兰西斯·柯林斯(Francis Collins)共同出席了由美国总统比尔·克林顿主持的基因组计划完成宣告[3]。

2002年,塞雷拉公司董事会将凡特解雇。

 目前工作
凡特目前是克莱格·凡特研究所(J. Craig Venter Institute,由TIGR所建立)的主席,这家研究机构跨足许多不同领域。2005年,他与其他人合伙建立了合成基因组公司(Synthetic Genomics),专门以经过改造的微生物生产作为替代燃料的乙醇(酒精)与氢。凡特的研究小组有一艘由游艇改装成的研究船,称为“魔法师二号”(Sorcerer II),专门研究海洋微生物[4]。

2007年5月10日,凡特获得亚利桑那大学的荣誉学位[5]。

2010年5月,克莱格的研究小组宣布他们已成功制造出世界第一个人造生命细胞[6]。

相关链接编辑本段回目录

参考文献编辑本段回目录

http://tech.sina.com.cn/d/2010-05-31/17164250941.shtml
http://en.wikipedia.org/wiki/Craig_Venter

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标签: 克雷格·文特 J. Craig Venter

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同义词: John Craig Venter,J. Craig Venter,Craig Venter

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