基因组学年代终结编辑本段回目录
美国著名的基因组学公司赛勒拉（Celera）最近宣布，将关闭其在马里兰州Rockville市41,000平方英尺的研发部门，裁减当地剩余25名员工中的20名。
在赛勒拉正式宣布关闭马里兰研发部门之前，已经有多家基因组公司改组或重新定位自己的发展方向。这一决定被媒体称作“以赛勒拉为代表的基因组学年代的正式终结”。
诱惑变困惑
成立于1998年的赛勒拉公司，是由美国基因组学研究所的著名基因组学家Craig Venter博士和当时的Perkin-Elmer公司（后被Applera公司收购）共同创办的，以基因组学信息的应用研究和商业化运作为主业。Venter担任第一任总裁，直到2004年离职。公司成立前，Venter领导的团队成功地完成了第一个完整的生物体基因组测序。虽然当时已有多家基因组公司在基因组测序和信息服务方面运作多年，但Venter团队的技术更加高效和经济。
公司成立后不久，正好赶上本世纪初的人类基因组热和生物技术产业投资热。赛勒拉借助其母公司的实力和华尔街投资银行的鼎力支持，在1999年以Applera公司的子公司形式成功在美国纳斯达克上市，募集到大笔资金。这家没有什么实际收入的生物技术公司，上市不到两年就被炒高股票，股价一路冲高，翻了十几倍，曾达到每股250美元的顶峰，创造了生物技术产业的神话、奇迹和泡沫。
不过，2000年以后，赛勒拉公司股票开始一路下滑，直到2003年后期才稳定在十几美元的正常水平。
公司在测定第一个人类组基因序列中独领风骚，后来居上。其采用的弥弹型测序方法既快又省，花费只是政府NIH资助的人基因组测序30亿美元的十分之一。
2001年，赛勒拉公司在科学杂志上发表了人类基因组第一张序列图。随后，它获得了NIH 2100万美元的资助，开展小鼠基因组的测序工作。公司很快就完成了小鼠的基因图谱，但只允许学术性单位免费使用数据库。此举遭到了业内人士的批评。因为虽然赛勒拉采用不同的技术路线在更短的时间内完成了整个测序，但其还是利用了许多已经公布于众的信息，是站在前人的肩膀上才走出了自己的捷径。
一年后，NIH的小鼠基因组测序也宣告完成，随即公布所有的信息。NIH效率虽低，起步却早。当赛勒拉开始做全序列测定时，NIH组织的基因测序已经过半。赛勒拉公司通过数据库赚钱的如意算盘由此落空。
鼎盛时期，赛勒拉曾在马里兰州雇有550员工。在人类基因组图谱绘制和测序中，赛勒拉起了非常关键的领军作用。但由于基因组测序完成后，基因组学平台服务公司的模式不被看好，公司被迫进行战略调整，不断裁减基因组学研究的研发人员和业务部分。2008年，赛勒拉公司宣布将总部搬迁至加州。
被迫转型新药开发
公司手中有大把现金，但缺乏真正的产品和可持续发展的商业模式，使得公司股票在2000年泡沫消失后一直低迷不振。为了生存和发展，大股东Applera决定对公司进行大刀阔斧的改组。
2002年1月，Venter离开了公司。有消息称，他的离职正是因为与Applera首席执行官Tony White在发展方向上有重大分歧。Tony很快挑选了女强人Ordonez 出任公司总裁。
Ordonez上任后，马上裁减了从事DNA测序和信息服务的132名员工。
2003年，赛勒拉公司股票跌去50%。当时公司拥有人类基因组信息庞大的数据库和无形资产，以及8.64亿美元的现金，现金在生物技术公司中算是比较丰富的。但是，赛勒拉公司仍未找到自己的发展方向。
之后，公司开始进行收购和技术合作等一系列交易活动。2003年收购了生物技术公司Axys Pharmaceuticals，出资1.75亿美元；先后又与雅培、基因泰克、通用电气等签署合作协议，为这些公司提供开发抗肿瘤药和其他靶向治疗产品。
到2004年底，Ordonez已经把核心业务从基因信息服务公司转型成为新药研发和诊断产品开发公司，度过了最困难的时期，同时还保留了7亿美元现金。
近几年，赛勒拉利用自己在基因组和数据库方面的优势，通过技术开发合作、转让和兼并，不断地构建自己的个性化诊疗服务的产品开发和服务体系。公司从仅仅靠基因组数据库订阅服务为主营业务逐渐脱胎换骨，变成有自己独特诊断测试和服务、有新药研发服务及项目、并有广泛战略合作网络的生物技术公司。
赛勒拉目前还不能说已经取得转型的成功。但与其他类似公司相比，赛勒拉有Applera公司强大的背景和支持，应该还是有很大胜算的。
当然，基因组测序和分析服务与新药开发有很大差异，要取得转型成功一定要充分利用基因组学公司的历史积累和技术优势。由于基因组学公司有自己的工具和数据库，其技术优势和经验有助于找到更好的生物学标记物，用于诊断和靶向治疗。尽管开发这类产品和服务需要时间、资金和经验，但开发新药需要这么长的周期、这么多的资金和人力物力投入，以基因组学为平台的生物技术公司要做好转型并不容易。
而随着更多基因功能被鉴定，以及更多生物标记物被发现，基因组学公司在个性化医疗诊断和遗传信息服务将有较大的发展潜力。
链接 艰难的转型后岁月
业内人士都不否认，转型，是基因组学类公司发展的必由之路。同处马里兰的人类基因科学公司（HGS）早在2000年就开始调整其发展战略，现在已经成为一家开发生物技术产品和临床治疗药物的公司。
成立于1992年的人类基因组科学公司最初也是单纯的基因组测序和数据库服务公司，曾经与史克公司签约过上亿美元的基因组学服务协议。2000年后，该公司开始转型，将自己定位为发现、开发、生产和销售创新药的公司，主要开发的产品是生物大分子蛋白药物和抗体药物。
根据2008年所披露的信息，HGS公司拥有许多涉及丙肝、癌症、红斑狼疮、关节炎和艾滋病治疗领域的新药开发库候选产品。其中有3个进入临床Ⅲ期：与葛兰素史克合作的红斑狼疮治疗药物Belimumab、与诺华合作的丙肝治疗药物Albuferon，以及与美国政府合作的炭疽防治药物Abthrax。
从基本经营状况看，HGS的转型相当艰难，现在还谈不上成功。HGS公司在1999~2000年曾募集了20亿美元。但由于经验不足，加上运气不佳，先后有两项新药研发项目以失败而告终。2004年，公司创办人退休离职，由比较有经验的职业经理人Thomas Watkins担任CEO。
目前判断HGS转型成功与否，就要看其上市产品能否赚钱。公司今年第一季度的报表还不错，1.77亿美元的收入远高于2008全年的4800万美元。不过，投资界对其疑虑重重。因为公司只有1.9亿美元的现金，却有近6亿美元的债务。公司的股票从顶峰时期的140美元下滑到如今的2~3美元，市值不到3亿美元，很可能会被某家大型药厂所收购。
Incyte Genomics公司是另一家基因组学研发公司，最初也是以基因测序和基因数据库服务为主业的公司，同样经历2000年股票的水涨船高，冲高到每股140美元以上。
2004年，公司改名为Incyte Corporatioin，经营方向变成了新药研发公司。公司曾经花费几千万美元用于基因序列专利保护，现在改走小分子新药专利申请。2005年后期，公司与辉瑞建立了长期战略合作关系。
目前Incyte公司新药合作及技术转让方面的收入有几百万美元，并有多项产品处于合作开发阶段。但是，公司目前股价只有2.5美元，市值滑落到2.85亿美元，持有现金1.75亿美元，每个季度研发费用和其他开支大约为4300万美元，负债近4亿美元，收入主要靠合作伙伴提供的资金支持和技术转让费。新药研发项目进展不顺利，或资本市场回暖过慢，都会给公司带来很大的压力。
对于像HGS和Incyte这样独立运营的生物技术公司，从一度有现金5亿~10亿美元，股价高达140美元的泡沫型公司，如今变成不断烧钱、债台高筑、豪赌新药研发的公司，反差巨大。如果这类公司在未来12个月内没有好的临床数据问世，它们的融资机会和生存空间就会受到威胁。
在赛勒拉正式宣布关闭马里兰研发部门之前，已经有多家基因组公司改组或重新定位自己的发展方向。这一决定被媒体称作“以赛勒拉为代表的基因组学年代的正式终结”。
成立于1998年的赛勒拉公司，是由美国基因组学研究所的著名基因组学家Craig Venter博士和当时的Perkin-Elmer公司（后被Applera公司收购）共同创办的，以基因组学信息的应用研究和商业化运作为主业。Venter担任第一任总裁，直到2004年离职。公司成立前，Venter领导的团队成功地完成了第一个完整的生物体基因组测序。虽然当时已有多家基因组公司在基因组测序和信息服务方面运作多年，但Venter团队的技术更加高效和经济。
公司成立后不久，正好赶上本世纪初的人类基因组热和生物技术产业投资热。赛勒拉借助其母公司的实力和华尔街投资银行的鼎力支持，在1999年以Applera公司的子公司形式成功在美国纳斯达克上市，募集到大笔资金。这家没有什么实际收入的生物技术公司，上市不到两年就被炒高股票，股价一路冲高，翻了十几倍，曾达到每股250美元的顶峰，创造了生物技术产业的神话、奇迹和泡沫。
不过，2000年以后，赛勒拉公司股票开始一路下滑，直到2003年后期才稳定在十几美元的正常水平。
公司在测定第一个人类组基因序列中独领风骚，后来居上。其采用的弥弹型测序方法既快又省，花费只是政府NIH资助的人基因组测序30亿美元的十分之一。
2001年，赛勒拉公司在科学杂志上发表了人类基因组第一张序列图。随后，它获得了NIH 2100万美元的资助，开展小鼠基因组的测序工作。公司很快就完成了小鼠的基因图谱，但只允许学术性单位免费使用数据库。此举遭到了业内人士的批评。因为虽然赛勒拉采用不同的技术路线在更短的时间内完成了整个测序，但其还是利用了许多已经公布于众的信息，是站在前人的肩膀上才走出了自己的捷径。
一年后，NIH的小鼠基因组测序也宣告完成，随即公布所有的信息。NIH效率虽低，起步却早。当赛勒拉开始做全序列测定时，NIH组织的基因测序已经过半。赛勒拉公司通过数据库赚钱的如意算盘由此落空。
鼎盛时期，赛勒拉曾在马里兰州雇有550员工。在人类基因组图谱绘制和测序中，赛勒拉起了非常关键的领军作用。但由于基因组测序完成后，基因组学平台服务公司的模式不被看好，公司被迫进行战略调整，不断裁减基因组学研究的研发人员和业务部分。2008年，赛勒拉公司宣布将总部搬迁至加州。
被迫转型新药开发
公司手中有大把现金，但缺乏真正的产品和可持续发展的商业模式，使得公司股票在2000年泡沫消失后一直低迷不振。为了生存和发展，大股东Applera决定对公司进行大刀阔斧的改组。
2002年1月，Venter离开了公司。有消息称，他的离职正是因为与Applera首席执行官Tony White在发展方向上有重大分歧。Tony很快挑选了女强人Ordonez 出任公司总裁。
Ordonez上任后，马上裁减了从事DNA测序和信息服务的132名员工。
2003年，赛勒拉公司股票跌去50%。当时公司拥有人类基因组信息庞大的数据库和无形资产，以及8.64亿美元的现金，现金在生物技术公司中算是比较丰富的。但是，赛勒拉公司仍未找到自己的发展方向。
到2004年底，Ordonez已经把核心业务从基因信息服务公司转型成为新药研发和诊断产品开发公司，度过了最困难的时期，同时还保留了7亿美元现金。
近几年，赛勒拉利用自己在基因组和数据库方面的优势，通过技术开发合作、转让和兼并，不断地构建自己的个性化诊疗服务的产品开发和服务体系。公司从仅仅靠基因组数据库订阅服务为主营业务逐渐脱胎换骨，变成有自己独特诊断测试和服务、有新药研发服务及项目、并有广泛战略合作网络的生物技术公司。
赛勒拉目前还不能说已经取得转型的成功。但与其他类似公司相比，赛勒拉有Applera公司强大的背景和支持，应该还是有很大胜算的。
当然，基因组测序和分析服务与新药开发有很大差异，要取得转型成功一定要充分利用基因组学公司的历史积累和技术优势。由于基因组学公司有自己的工具和数据库，其技术优势和经验有助于找到更好的生物学标记物，用于诊断和靶向治疗。尽管开发这类产品和服务需要时间、资金和经验，但开发新药需要这么长的周期、这么多的资金和人力物力投入，以基因组学为平台的生物技术公司要做好转型并不容易。
而随着更多基因功能被鉴定，以及更多生物标记物被发现，基因组学公司在个性化医疗诊断和遗传信息服务将有较大的发展潜力。
链接 艰难的转型后岁月
业内人士都不否认，转型，是基因组学类公司发展的必由之路。同处马里兰的人类基因科学公司（HGS）早在2000年就开始调整其发展战略，现在已经成为一家开发生物技术产品和临床治疗药物的公司。
成立于1992年的人类基因组科学公司最初也是单纯的基因组测序和数据库服务公司，曾经与史克公司签约过上亿美元的基因组学服务协议。2000年后，该公司开始转型，将自己定位为发现、开发、生产和销售创新药的公司，主要开发的产品是生物大分子蛋白药物和抗体药物。
根据2008年所披露的信息，HGS公司拥有许多涉及丙肝、癌症、红斑狼疮、关节炎和艾滋病治疗领域的新药开发库候选产品。其中有3个进入临床Ⅲ期：与葛兰素史克合作的红斑狼疮治疗药物Belimumab、与诺华合作的丙肝治疗药物Albuferon，以及与美国政府合作的炭疽防治药物Abthrax。
从基本经营状况看，HGS的转型相当艰难，现在还谈不上成功。HGS公司在1999~2000年曾募集了20亿美元。但由于经验不足，加上运气不佳，先后有两项新药研发项目以失败而告终。2004年，公司创办人退休离职，由比较有经验的职业经理人Thomas Watkins担任CEO。
目前判断HGS转型成功与否，就要看其上市产品能否赚钱。公司今年第一季度的报表还不错，1.77亿美元的收入远高于2008全年的4800万美元。不过，投资界对其疑虑重重。因为公司只有1.9亿美元的现金，却有近6亿美元的债务。公司的股票从顶峰时期的140美元下滑到如今的2~3美元，市值不到3亿美元，很可能会被某家大型药厂所收购。
Incyte Genomics公司是另一家基因组学研发公司，最初也是以基因测序和基因数据库服务为主业的公司，同样经历2000年股票的水涨船高，冲高到每股140美元以上。
2004年，公司改名为Incyte Corporatioin，经营方向变成了新药研发公司。公司曾经花费几千万美元用于基因序列专利保护，现在改走小分子新药专利申请。2005年后期，公司与辉瑞建立了长期战略合作关系。
目前Incyte公司新药合作及技术转让方面的收入有几百万美元，并有多项产品处于合作开发阶段。但是，公司目前股价只有2.5美元，市值滑落到2.85亿美元，持有现金1.75亿美元，每个季度研发费用和其他开支大约为4300万美元，负债近4亿美元，收入主要靠合作伙伴提供的资金支持和技术转让费。新药研发项目进展不顺利，或资本市场回暖过慢，都会给公司带来很大的压力。
对于像HGS和Incyte这样独立运营的生物技术公司，从一度有现金5亿~10亿美元，股价高达140美元的泡沫型公司，如今变成不断烧钱、债台高筑、豪赌新药研发的公司，反差巨大。如果这类公司在未来12个月内没有好的临床数据问世，它们的融资机会和生存空间就会受到威胁。
10年之后,基因组学革命刚刚开始编辑本段回目录
新华网北京2010年6月27日电 记者林小春
今年是人类基因组工作草图问世10周年。回首望去,尽管有价值的医学应用还极为有限,但过去的10年依然是生命科学激动人心的10年,人类在对自身和疾病的认识上都发生了飞跃性的变化。
然而,基因组学研究是一项长期投资,美国塞莱拉遗传公司创始人克雷格文特尔希望人们保持耐心,因为“基因组学革命只不过才刚刚开始”。
人类重新认识自己人类基因组计划于1990年启动,2000年工作草图绘制完毕,3年后正式完成了全部30亿个碱基对的测序工作。科学家称赞这个计划比人类登上月球还要伟大。2000年6月26日,时任美国总统克林顿在评价工作草图的意义时说,这项里程碑式的科学成果“将使多数人类疾病的诊断、预防和治疗发生革命性变化”。
10年之后,虽然克林顿的预言尚未成为现实,但人类基因组计划已给生命科学带来了深远影响。
首先是人类重新认识了自己。在基因组图谱问世前,科学家曾认为人体内有数十万个蛋白编码基因,这样才能解释人类复杂的生命结构。但令人吃惊的是,基因组图谱显示,人类的基因只有2.1万个左右,和老鼠相差无几,而且两者有99%的基因相同。有的科学家猜测,虽然人类基因数量与老鼠差不多,但人类基因的机能要远比其他动物复杂。
最出人意料的也许是基因组测序技术的飞速发展。当时绘制首份基因组草图需要多国科学家联手,耗时10年,耗资30亿美元。现在,一个由几个人组成的研究小组,可以在一天之内以不到1万美元的成本完成同样的工作。这个费用在未来3年到5年内有可能降到1000美元以内,而时间预计只需15分钟左右。
测序成本直线下降使科学家有能力破译人类之外生物的基因组。有关统计表明,从老鼠到果蝇,从线虫到马铃薯,至少3800种有机体的基因组图谱已经绘制完成。
此外,基因组测序的成功,直接催生了许多“大生物”工程,比如2002年启动的国际人类基因组单体型图计划(HapMap),用3年时间绘制了详细的人类基因组差异图;又如始于2003年的DNA(脱氧核糖核酸)元件百科全书计划,目标是找出人类基因组中的功能元件。
基因组学 科技名词定义编辑本段回目录
中文名称：基因组学 英文名称：genomics 定义1：研究基因组的结构、功能及表达产物的学科。基因组的产物不仅是蛋白质，还有许多复杂功能的RNA。包括三个不同的亚领域，即结构基因组学、功能基因组学和比较基因组学。 所属学科： 生物化学与分子生物学(一级学科) ；总论(二级学科) 定义2：研究生物体全基因组DNA的序列和属性的学科。包括在DNA（基因型）、mRNA（转录物组）和蛋白质（蛋白质组）水平上研究细胞或组织的所有基因。 所属学科： 细胞生物学(一级学科) ；总论(二级学科) 定义3：研究生物体基因组的组成、结构与功能的学科。 所属学科： 遗传学(一级学科) ；总论(二级学科)
本内容由全国科学技术名词审定委员会审定公布
基因组学（英文genomics），台湾译作基因体学，研究生物基因组和如何利用基因的一门学问。用于概括涉及基因作图、测序和整个基因组功能分析的遗传学分支。该学科提供基因组信息以及相关数据系统利用，试图解决生物，医学，和工业领域的重大问题。 基因组学能为一些疾病提供新的诊断，治疗方法。例如，对刚诊断为乳腺癌的女性，一个名为“Oncotype DX”的基因组测试，能用来评估病人乳腺癌复发的个体危险率以及化疗效果，这有助于医生获得更多的治疗信息并进行个性化医疗。基因组学还被用于食品与农业部门。 基因组学的主要工具和方法包括： 生物信息学，遗传分析，基因表达测量和基因功能鉴定 基因组学出现于1980年代，1990年代随着几个物种基因组计划的启动，基因组学取得长足发展。 相关领域是遗传学，其研究基因以及在遗传中的功能。 1980年，噬菌体 Φ-X174;(5,368 碱基对)完全测序，成为第一个测定的基因组。 1995年，嗜血流感菌（Haemophilus influenzae，1.8Mb）测序完成，是第一个测定的自由生活物种。从这时起，基因组测序工作迅速展开。 2001年，人类基因组计划公布了人类基因组草图，为基因组学研究揭开新的一页。 基因组学是研究生物基因组的组成,组内各基因的精确结构、相互关系及表达调控的科学。基因组学、转录组学、蛋白质组学与代谢组学等一同构成系统生物学的组学（omics）生物技术基础。 “组学”的增长 主条目：-组学 “组”（来源于希腊语，意为‘所有’，‘每个’或‘全部’）这个后缀最初用于基因组，意指一个物种的全部遗传组成。 由于诸如基因组测序这样的大规模定量生物项目的成功，后缀“组”的使用已经扩展到其他相关领域。例如，蛋白质组指的是一个物种，组织或细胞内的全部蛋白质（表达的基因这里指被翻译成蛋白质）。蛋白质组学现在已经作为研究蛋白质组的专业术语。
参考文献编辑本段回目录
http://www.biotech.org.cn/fruit/news_show.php?id=69720
http://www.anhuinews.com/zhuyeguanli/system/2010/06/27/003199386.shtml
http://www.anhuinews.com/zhuyeguanli/system/2010/06/27/003199386.shtml
